Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HERVK_113P62684 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
HERVK_113P62684 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms