Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARF6P62330 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARF6P62330 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARF6P62330 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARF6P62330 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARF6P62330 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARF6P62330 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARF6P62330 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARF6P62330 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARF6P62330 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARF6P62330 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ARF6P62330 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ARF6P62330 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARF6P62330 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARF6P62330 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARF6P62330 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ARF6P62330 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ARF6P62330 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARF6P62330 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARF6P62330 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARF6P62330 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARF6P62330 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARF6P62330 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARF6P62330 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARF6P62330 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARF6P62330 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARF6P62330 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARF6P62330 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARF6P62330 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARF6P62330 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ARF6P62330 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARF6P62330 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARF6P62330 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARF6P62330 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARF6P62330 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARF6P62330 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ARF6P62330 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARF6P62330 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARF6P62330 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARF6P62330 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARF6P62330 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARF6P62330 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARF6P62330 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ARF6P62330 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ARF6P62330 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ARF6P62330 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARF6P62330 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARF6P62330 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF6P62330 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF6P62330 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF6P62330 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF6P62330 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF6P62330 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF6P62330 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF6P62330 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF6P62330 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF6P62330 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF6P62330 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF6P62330 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF6P62330 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF6P62330 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF6P62330 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF6P62330 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF6P62330 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF6P62330 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF6P62330 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF6P62330 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARF6P62330 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARF6P62330 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARF6P62330 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARF6P62330 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARF6P62330 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARF6P62330 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARF6P62330 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARF6P62330 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARF6P62330 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARF6P62330 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARF6P62330 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARF6P62330 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARF6P62330 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARF6P62330 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARF6P62330 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARF6P62330 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARF6P62330 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARF6P62330 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARF6P62330 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARF6P62330 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARF6P62330 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARF6P62330 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARF6P62330 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ARF6P62330 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ARF6P62330 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARF6P62330 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARF6P62330 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ARF6P62330 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ARF6P62330 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ARF6P62330 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ARF6P62330 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARF6P62330 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARF6P62330 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms