Protein–RNA interactions for Protein: P62079

TSPAN5, Tetraspanin-5, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN5P62079 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TSPAN5P62079 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSPAN5P62079 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSPAN5P62079 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSPAN5P62079 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TSPAN5P62079 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSPAN5P62079 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSPAN5P62079 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSPAN5P62079 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSPAN5P62079 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSPAN5P62079 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSPAN5P62079 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSPAN5P62079 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSPAN5P62079 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSPAN5P62079 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSPAN5P62079 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSPAN5P62079 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSPAN5P62079 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSPAN5P62079 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSPAN5P62079 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSPAN5P62079 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSPAN5P62079 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSPAN5P62079 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSPAN5P62079 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TSPAN5P62079 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TSPAN5P62079 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TSPAN5P62079 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TSPAN5P62079 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TSPAN5P62079 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TSPAN5P62079 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TSPAN5P62079 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TSPAN5P62079 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TSPAN5P62079 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TSPAN5P62079 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms