Protein–RNA interactions for Protein: P61578

ERVK-16, Endogenous retrovirus group K member 16 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-16P61578 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-16P61578 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-16P61578 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-16P61578 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-16P61578 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-16P61578 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-16P61578 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-16P61578 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-16P61578 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-16P61578 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-16P61578 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-16P61578 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-16P61578 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms