Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB2AP61019 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB2AP61019 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB2AP61019 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB2AP61019 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB2AP61019 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB2AP61019 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB2AP61019 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB2AP61019 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB2AP61019 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB2AP61019 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB2AP61019 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB2AP61019 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB2AP61019 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB2AP61019 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB2AP61019 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB2AP61019 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB2AP61019 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB2AP61019 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB2AP61019 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB2AP61019 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB2AP61019 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB2AP61019 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB2AP61019 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB2AP61019 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB2AP61019 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB2AP61019 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB2AP61019 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB2AP61019 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB2AP61019 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB2AP61019 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB2AP61019 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB2AP61019 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB2AP61019 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB2AP61019 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB2AP61019 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB2AP61019 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB2AP61019 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB2AP61019 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB2AP61019 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB2AP61019 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB2AP61019 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB2AP61019 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB2AP61019 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB2AP61019 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB2AP61019 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RAB2AP61019 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB2AP61019 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms