Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTXN1P60606 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTXN1P60606 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms