Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2BFSP57053 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2BFSP57053 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
H2BFSP57053 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2BFSP57053 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2BFSP57053 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
H2BFSP57053 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2BFSP57053 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2BFSP57053 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2BFSP57053 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2BFSP57053 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2BFSP57053 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2BFSP57053 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2BFSP57053 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2BFSP57053 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2BFSP57053 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2BFSP57053 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2BFSP57053 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2BFSP57053 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2BFSP57053 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2BFSP57053 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms