Protein–RNA interactions for Protein: P55273

CDKN2D, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2DP55273 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN2DP55273 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN2DP55273 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN2DP55273 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN2DP55273 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN2DP55273 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN2DP55273 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN2DP55273 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN2DP55273 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN2DP55273 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN2DP55273 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN2DP55273 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN2DP55273 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN2DP55273 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN2DP55273 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN2DP55273 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN2DP55273 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN2DP55273 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2DP55273 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2DP55273 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2DP55273 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2DP55273 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2DP55273 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2DP55273 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2DP55273 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2DP55273 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2DP55273 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2DP55273 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2DP55273 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2DP55273 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN2DP55273 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN2DP55273 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN2DP55273 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN2DP55273 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN2DP55273 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN2DP55273 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN2DP55273 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN2DP55273 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN2DP55273 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN2DP55273 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN2DP55273 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN2DP55273 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CDKN2DP55273 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms