Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPHB4P54760 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
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