Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP12AP54707 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ATP12AP54707 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ATP12AP54707 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ATP12AP54707 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ATP12AP54707 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP12AP54707 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP12AP54707 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP12AP54707 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP12AP54707 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP12AP54707 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP12AP54707 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP12AP54707 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP12AP54707 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP12AP54707 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP12AP54707 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP12AP54707 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP12AP54707 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP12AP54707 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP12AP54707 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP12AP54707 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP12AP54707 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP12AP54707 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP12AP54707 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP12AP54707 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP12AP54707 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP12AP54707 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP12AP54707 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP12AP54707 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP12AP54707 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP12AP54707 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP12AP54707 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP12AP54707 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP12AP54707 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP12AP54707 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP12AP54707 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP12AP54707 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP12AP54707 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP12AP54707 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP12AP54707 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP12AP54707 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP12AP54707 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP12AP54707 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP12AP54707 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP12AP54707 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP12AP54707 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP12AP54707 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP12AP54707 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP12AP54707 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP12AP54707 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms