Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNB3P54284 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNB3P54284 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNB3P54284 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNB3P54284 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNB3P54284 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNB3P54284 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNB3P54284 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNB3P54284 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNB3P54284 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNB3P54284 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNB3P54284 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNB3P54284 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNB3P54284 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNB3P54284 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNB3P54284 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNB3P54284 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNB3P54284 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNB3P54284 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNB3P54284 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNB3P54284 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNB3P54284 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNB3P54284 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNB3P54284 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNB3P54284 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNB3P54284 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNB3P54284 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNB3P54284 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNB3P54284 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNB3P54284 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNB3P54284 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNB3P54284 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNB3P54284 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNB3P54284 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNB3P54284 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNB3P54284 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNB3P54284 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNB3P54284 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CACNB3P54284 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNB3P54284 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms