Protein–RNA interactions for Protein: P54252

ATXN3, Ataxin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3P54252 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATXN3P54252 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN3P54252 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms