Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
POLR2KP53803 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2KP53803 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 233.7 ms