Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
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