Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
THOP1P52888 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
THOP1P52888 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THOP1P52888 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THOP1P52888 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
THOP1P52888 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THOP1P52888 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THOP1P52888 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THOP1P52888 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THOP1P52888 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
THOP1P52888 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THOP1P52888 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THOP1P52888 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THOP1P52888 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THOP1P52888 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THOP1P52888 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THOP1P52888 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THOP1P52888 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THOP1P52888 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THOP1P52888 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THOP1P52888 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THOP1P52888 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THOP1P52888 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THOP1P52888 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THOP1P52888 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THOP1P52888 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THOP1P52888 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THOP1P52888 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THOP1P52888 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THOP1P52888 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THOP1P52888 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THOP1P52888 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THOP1P52888 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THOP1P52888 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THOP1P52888 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THOP1P52888 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THOP1P52888 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THOP1P52888 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THOP1P52888 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THOP1P52888 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THOP1P52888 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THOP1P52888 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THOP1P52888 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THOP1P52888 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THOP1P52888 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THOP1P52888 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THOP1P52888 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
THOP1P52888 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
THOP1P52888 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THOP1P52888 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
THOP1P52888 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THOP1P52888 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THOP1P52888 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THOP1P52888 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THOP1P52888 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
THOP1P52888 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THOP1P52888 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THOP1P52888 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THOP1P52888 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THOP1P52888 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THOP1P52888 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THOP1P52888 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THOP1P52888 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THOP1P52888 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THOP1P52888 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THOP1P52888 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
THOP1P52888 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THOP1P52888 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THOP1P52888 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THOP1P52888 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THOP1P52888 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
THOP1P52888 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THOP1P52888 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
THOP1P52888 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THOP1P52888 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THOP1P52888 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
THOP1P52888 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THOP1P52888 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THOP1P52888 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THOP1P52888 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THOP1P52888 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THOP1P52888 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THOP1P52888 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THOP1P52888 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THOP1P52888 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THOP1P52888 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THOP1P52888 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THOP1P52888 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THOP1P52888 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THOP1P52888 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
THOP1P52888 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THOP1P52888 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THOP1P52888 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THOP1P52888 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THOP1P52888 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THOP1P52888 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THOP1P52888 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THOP1P52888 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THOP1P52888 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THOP1P52888 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms