Protein–RNA interactions for Protein: P52849

NDST2, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST2P52849 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NDST2P52849 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDST2P52849 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDST2P52849 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDST2P52849 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDST2P52849 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDST2P52849 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDST2P52849 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDST2P52849 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDST2P52849 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDST2P52849 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDST2P52849 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDST2P52849 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDST2P52849 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDST2P52849 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDST2P52849 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDST2P52849 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDST2P52849 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDST2P52849 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NDST2P52849 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDST2P52849 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDST2P52849 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NDST2P52849 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NDST2P52849 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NDST2P52849 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDST2P52849 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDST2P52849 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDST2P52849 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDST2P52849 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NDST2P52849 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDST2P52849 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDST2P52849 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDST2P52849 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDST2P52849 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDST2P52849 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDST2P52849 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDST2P52849 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDST2P52849 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDST2P52849 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDST2P52849 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDST2P52849 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NDST2P52849 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDST2P52849 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDST2P52849 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NDST2P52849 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDST2P52849 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDST2P52849 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDST2P52849 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDST2P52849 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDST2P52849 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDST2P52849 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDST2P52849 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NDST2P52849 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDST2P52849 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDST2P52849 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDST2P52849 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDST2P52849 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDST2P52849 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDST2P52849 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDST2P52849 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDST2P52849 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDST2P52849 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDST2P52849 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDST2P52849 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDST2P52849 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDST2P52849 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDST2P52849 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDST2P52849 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDST2P52849 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDST2P52849 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NDST2P52849 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDST2P52849 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDST2P52849 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDST2P52849 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NDST2P52849 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NDST2P52849 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDST2P52849 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDST2P52849 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDST2P52849 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDST2P52849 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDST2P52849 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDST2P52849 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDST2P52849 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDST2P52849 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDST2P52849 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NDST2P52849 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
NDST2P52849 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NDST2P52849 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NDST2P52849 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDST2P52849 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NDST2P52849 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NDST2P52849 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDST2P52849 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDST2P52849 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDST2P52849 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDST2P52849 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDST2P52849 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NDST2P52849 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDST2P52849 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDST2P52849 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms