Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF2A1P52655 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2A1P52655 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2A1P52655 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms