Protein–RNA interactions for Protein: P51668

UBE2D1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D1P51668 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2D1P51668 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms