Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCNN1GP51170 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms