Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCT8P50990 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCT8P50990 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCT8P50990 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCT8P50990 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCT8P50990 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCT8P50990 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCT8P50990 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCT8P50990 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCT8P50990 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCT8P50990 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCT8P50990 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCT8P50990 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCT8P50990 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCT8P50990 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCT8P50990 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCT8P50990 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCT8P50990 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCT8P50990 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCT8P50990 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCT8P50990 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCT8P50990 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCT8P50990 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCT8P50990 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCT8P50990 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCT8P50990 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCT8P50990 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCT8P50990 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCT8P50990 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCT8P50990 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCT8P50990 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCT8P50990 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCT8P50990 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCT8P50990 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCT8P50990 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCT8P50990 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCT8P50990 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCT8P50990 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCT8P50990 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCT8P50990 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCT8P50990 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCT8P50990 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCT8P50990 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCT8P50990 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCT8P50990 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCT8P50990 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCT8P50990 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCT8P50990 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCT8P50990 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCT8P50990 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCT8P50990 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCT8P50990 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCT8P50990 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCT8P50990 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCT8P50990 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCT8P50990 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCT8P50990 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCT8P50990 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCT8P50990 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCT8P50990 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCT8P50990 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCT8P50990 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCT8P50990 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCT8P50990 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCT8P50990 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCT8P50990 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCT8P50990 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCT8P50990 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCT8P50990 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCT8P50990 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCT8P50990 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCT8P50990 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCT8P50990 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCT8P50990 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCT8P50990 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCT8P50990 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCT8P50990 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCT8P50990 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCT8P50990 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCT8P50990 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCT8P50990 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCT8P50990 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCT8P50990 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCT8P50990 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCT8P50990 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCT8P50990 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCT8P50990 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCT8P50990 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCT8P50990 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCT8P50990 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCT8P50990 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCT8P50990 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCT8P50990 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCT8P50990 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCT8P50990 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCT8P50990 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCT8P50990 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCT8P50990 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCT8P50990 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCT8P50990 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms