Protein–RNA interactions for Protein: P50591

TNFSF10, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 10, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF10P50591 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
TNFSF10P50591 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFSF10P50591 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFSF10P50591 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFSF10P50591 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFSF10P50591 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFSF10P50591 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFSF10P50591 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFSF10P50591 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFSF10P50591 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFSF10P50591 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFSF10P50591 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFSF10P50591 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFSF10P50591 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFSF10P50591 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFSF10P50591 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms