Protein–RNA interactions for Protein: P49720

PSMB3, Proteasome subunit beta type-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB3P49720 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB3P49720 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSMB3P49720 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSMB3P49720 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSMB3P49720 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB3P49720 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB3P49720 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB3P49720 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB3P49720 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB3P49720 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB3P49720 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB3P49720 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB3P49720 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB3P49720 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB3P49720 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB3P49720 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms