Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FNTAP49354 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FNTAP49354 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FNTAP49354 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FNTAP49354 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FNTAP49354 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FNTAP49354 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FNTAP49354 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FNTAP49354 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FNTAP49354 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FNTAP49354 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FNTAP49354 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FNTAP49354 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FNTAP49354 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FNTAP49354 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FNTAP49354 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FNTAP49354 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FNTAP49354 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FNTAP49354 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FNTAP49354 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FNTAP49354 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FNTAP49354 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FNTAP49354 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FNTAP49354 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FNTAP49354 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FNTAP49354 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FNTAP49354 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FNTAP49354 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FNTAP49354 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FNTAP49354 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FNTAP49354 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FNTAP49354 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNTAP49354 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNTAP49354 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNTAP49354 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNTAP49354 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNTAP49354 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FNTAP49354 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNTAP49354 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNTAP49354 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNTAP49354 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNTAP49354 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNTAP49354 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNTAP49354 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNTAP49354 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNTAP49354 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNTAP49354 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FNTAP49354 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FNTAP49354 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FNTAP49354 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FNTAP49354 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FNTAP49354 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FNTAP49354 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FNTAP49354 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FNTAP49354 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FNTAP49354 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FNTAP49354 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FNTAP49354 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FNTAP49354 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FNTAP49354 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FNTAP49354 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FNTAP49354 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FNTAP49354 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FNTAP49354 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FNTAP49354 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FNTAP49354 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FNTAP49354 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FNTAP49354 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FNTAP49354 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FNTAP49354 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FNTAP49354 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FNTAP49354 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FNTAP49354 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FNTAP49354 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNTAP49354 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNTAP49354 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNTAP49354 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FNTAP49354 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNTAP49354 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNTAP49354 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNTAP49354 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNTAP49354 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNTAP49354 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNTAP49354 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNTAP49354 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNTAP49354 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNTAP49354 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNTAP49354 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNTAP49354 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNTAP49354 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNTAP49354 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNTAP49354 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNTAP49354 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNTAP49354 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNTAP49354 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNTAP49354 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FNTAP49354 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNTAP49354 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNTAP49354 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNTAP49354 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms