Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMAN1P49257 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMAN1P49257 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms