Protein–RNA interactions for Protein: P48643

CCT5, T-complex protein 1 subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT5P48643 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCT5P48643 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCT5P48643 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCT5P48643 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCT5P48643 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCT5P48643 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCT5P48643 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCT5P48643 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCT5P48643 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCT5P48643 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCT5P48643 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCT5P48643 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCT5P48643 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCT5P48643 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCT5P48643 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCT5P48643 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCT5P48643 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCT5P48643 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCT5P48643 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCT5P48643 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCT5P48643 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCT5P48643 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCT5P48643 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCT5P48643 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCT5P48643 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCT5P48643 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCT5P48643 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCT5P48643 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCT5P48643 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCT5P48643 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCT5P48643 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCT5P48643 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCT5P48643 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCT5P48643 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCT5P48643 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCT5P48643 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCT5P48643 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCT5P48643 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT5P48643 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT5P48643 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT5P48643 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT5P48643 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT5P48643 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT5P48643 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT5P48643 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT5P48643 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT5P48643 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT5P48643 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT5P48643 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT5P48643 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT5P48643 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT5P48643 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT5P48643 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT5P48643 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT5P48643 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCT5P48643 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT5P48643 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT5P48643 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT5P48643 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT5P48643 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT5P48643 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT5P48643 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT5P48643 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT5P48643 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT5P48643 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT5P48643 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT5P48643 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT5P48643 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT5P48643 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT5P48643 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT5P48643 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT5P48643 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT5P48643 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT5P48643 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT5P48643 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT5P48643 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT5P48643 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT5P48643 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT5P48643 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT5P48643 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT5P48643 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT5P48643 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT5P48643 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT5P48643 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT5P48643 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT5P48643 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT5P48643 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT5P48643 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT5P48643 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT5P48643 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT5P48643 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT5P48643 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT5P48643 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT5P48643 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT5P48643 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT5P48643 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT5P48643 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT5P48643 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT5P48643 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT5P48643 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms