Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LSSP48449 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LSSP48449 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LSSP48449 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LSSP48449 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LSSP48449 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LSSP48449 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LSSP48449 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LSSP48449 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LSSP48449 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LSSP48449 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LSSP48449 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LSSP48449 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LSSP48449 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LSSP48449 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LSSP48449 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LSSP48449 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LSSP48449 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LSSP48449 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LSSP48449 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LSSP48449 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LSSP48449 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LSSP48449 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LSSP48449 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LSSP48449 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LSSP48449 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LSSP48449 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LSSP48449 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LSSP48449 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LSSP48449 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LSSP48449 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LSSP48449 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LSSP48449 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LSSP48449 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LSSP48449 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LSSP48449 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LSSP48449 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LSSP48449 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LSSP48449 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LSSP48449 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LSSP48449 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LSSP48449 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LSSP48449 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LSSP48449 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LSSP48449 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LSSP48449 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LSSP48449 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSSP48449 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSSP48449 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSSP48449 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSSP48449 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSSP48449 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSSP48449 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSSP48449 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSSP48449 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LSSP48449 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSSP48449 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LSSP48449 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSSP48449 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSSP48449 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSSP48449 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSSP48449 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSSP48449 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSSP48449 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSSP48449 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LSSP48449 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LSSP48449 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LSSP48449 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LSSP48449 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LSSP48449 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LSSP48449 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LSSP48449 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LSSP48449 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LSSP48449 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LSSP48449 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LSSP48449 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LSSP48449 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LSSP48449 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LSSP48449 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LSSP48449 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LSSP48449 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LSSP48449 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LSSP48449 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LSSP48449 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LSSP48449 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LSSP48449 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LSSP48449 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSSP48449 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSSP48449 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSSP48449 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSSP48449 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSSP48449 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LSSP48449 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSSP48449 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSSP48449 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSSP48449 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSSP48449 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSSP48449 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSSP48449 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSSP48449 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms