Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TM4SF4P48230 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TM4SF4P48230 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TM4SF4P48230 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms