Protein–RNA interactions for Protein: P47224

RABIF, Guanine nucleotide exchange factor MSS4, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABIFP47224 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABIFP47224 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABIFP47224 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RABIFP47224 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABIFP47224 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABIFP47224 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABIFP47224 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABIFP47224 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABIFP47224 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABIFP47224 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABIFP47224 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABIFP47224 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RABIFP47224 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RABIFP47224 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RABIFP47224 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RABIFP47224 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RABIFP47224 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
RABIFP47224 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RABIFP47224 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RABIFP47224 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RABIFP47224 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABIFP47224 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABIFP47224 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABIFP47224 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABIFP47224 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABIFP47224 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABIFP47224 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABIFP47224 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABIFP47224 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABIFP47224 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABIFP47224 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABIFP47224 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABIFP47224 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABIFP47224 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABIFP47224 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABIFP47224 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABIFP47224 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABIFP47224 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABIFP47224 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABIFP47224 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABIFP47224 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABIFP47224 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABIFP47224 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RABIFP47224 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RABIFP47224 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RABIFP47224 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RABIFP47224 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RABIFP47224 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RABIFP47224 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RABIFP47224 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RABIFP47224 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RABIFP47224 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RABIFP47224 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RABIFP47224 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RABIFP47224 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RABIFP47224 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RABIFP47224 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABIFP47224 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABIFP47224 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABIFP47224 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABIFP47224 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABIFP47224 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABIFP47224 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABIFP47224 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABIFP47224 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABIFP47224 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABIFP47224 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABIFP47224 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABIFP47224 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABIFP47224 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABIFP47224 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABIFP47224 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABIFP47224 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RABIFP47224 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RABIFP47224 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABIFP47224 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABIFP47224 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABIFP47224 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABIFP47224 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABIFP47224 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABIFP47224 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABIFP47224 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABIFP47224 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABIFP47224 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABIFP47224 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABIFP47224 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABIFP47224 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABIFP47224 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABIFP47224 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABIFP47224 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABIFP47224 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RABIFP47224 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RABIFP47224 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RABIFP47224 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABIFP47224 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABIFP47224 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABIFP47224 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABIFP47224 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABIFP47224 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABIFP47224 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms