Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms