Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RECQLP46063 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RECQLP46063 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RECQLP46063 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RECQLP46063 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RECQLP46063 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RECQLP46063 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RECQLP46063 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RECQLP46063 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RECQLP46063 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RECQLP46063 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RECQLP46063 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RECQLP46063 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RECQLP46063 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RECQLP46063 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RECQLP46063 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RECQLP46063 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RECQLP46063 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RECQLP46063 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RECQLP46063 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RECQLP46063 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RECQLP46063 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RECQLP46063 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RECQLP46063 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RECQLP46063 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RECQLP46063 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RECQLP46063 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RECQLP46063 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RECQLP46063 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RECQLP46063 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RECQLP46063 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RECQLP46063 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RECQLP46063 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RECQLP46063 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RECQLP46063 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RECQLP46063 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RECQLP46063 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RECQLP46063 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RECQLP46063 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RECQLP46063 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RECQLP46063 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RECQLP46063 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RECQLP46063 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RECQLP46063 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RECQLP46063 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RECQLP46063 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RECQLP46063 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RECQLP46063 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RECQLP46063 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RECQLP46063 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RECQLP46063 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RECQLP46063 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RECQLP46063 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RECQLP46063 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RECQLP46063 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RECQLP46063 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RECQLP46063 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RECQLP46063 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RECQLP46063 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RECQLP46063 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RECQLP46063 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RECQLP46063 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RECQLP46063 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RECQLP46063 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RECQLP46063 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RECQLP46063 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RECQLP46063 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RECQLP46063 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RECQLP46063 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RECQLP46063 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RECQLP46063 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RECQLP46063 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RECQLP46063 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RECQLP46063 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RECQLP46063 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RECQLP46063 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RECQLP46063 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RECQLP46063 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RECQLP46063 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RECQLP46063 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RECQLP46063 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RECQLP46063 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RECQLP46063 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RECQLP46063 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RECQLP46063 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RECQLP46063 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RECQLP46063 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RECQLP46063 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RECQLP46063 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RECQLP46063 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RECQLP46063 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RECQLP46063 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RECQLP46063 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RECQLP46063 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RECQLP46063 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RECQLP46063 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RECQLP46063 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RECQLP46063 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RECQLP46063 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RECQLP46063 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms