Protein–RNA interactions for Protein: P45985

MAP2K4, Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP2K4P45985 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MAP2K4P45985 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MAP2K4P45985 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms