Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIK3CBP42338 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PIK3CBP42338 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms