Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC34.1■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC34.08■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
KDM5CP41229 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
KDM5CP41229 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
KDM5CP41229 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM5CP41229 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM5CP41229 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM5CP41229 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM5CP41229 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM5CP41229 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM5CP41229 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM5CP41229 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM5CP41229 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM5CP41229 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM5CP41229 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM5CP41229 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
KDM5CP41229 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
KDM5CP41229 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
KDM5CP41229 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
KDM5CP41229 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
KDM5CP41229 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KDM5CP41229 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KDM5CP41229 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KDM5CP41229 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
KDM5CP41229 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
KDM5CP41229 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
KDM5CP41229 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
KDM5CP41229 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
KDM5CP41229 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
KDM5CP41229 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
KDM5CP41229 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM5CP41229 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM5CP41229 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM5CP41229 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM5CP41229 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM5CP41229 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM5CP41229 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM5CP41229 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM5CP41229 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM5CP41229 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM5CP41229 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM5CP41229 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
KDM5CP41229 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
KDM5CP41229 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
KDM5CP41229 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC34.01■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC34■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC33.97■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms