Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPHP41219 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPHP41219 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPHP41219 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPHP41219 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPHP41219 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPHP41219 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPHP41219 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPHP41219 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPHP41219 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPHP41219 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPHP41219 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPHP41219 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPHP41219 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPHP41219 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPHP41219 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPHP41219 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPHP41219 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPHP41219 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPHP41219 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPHP41219 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPHP41219 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPHP41219 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPHP41219 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPHP41219 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPHP41219 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PRPHP41219 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPHP41219 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPHP41219 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPHP41219 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPHP41219 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPHP41219 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPHP41219 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPHP41219 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPHP41219 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPHP41219 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPHP41219 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPHP41219 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPHP41219 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPHP41219 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPHP41219 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPHP41219 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPHP41219 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPHP41219 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPHP41219 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPHP41219 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPHP41219 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPHP41219 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPHP41219 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPHP41219 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPHP41219 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPHP41219 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPHP41219 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPHP41219 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPHP41219 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPHP41219 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPHP41219 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPHP41219 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPHP41219 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPHP41219 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPHP41219 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPHP41219 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPHP41219 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPHP41219 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPHP41219 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPHP41219 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPHP41219 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPHP41219 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPHP41219 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPHP41219 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPHP41219 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPHP41219 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPHP41219 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPHP41219 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPHP41219 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPHP41219 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPHP41219 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPHP41219 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPHP41219 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPHP41219 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPHP41219 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPHP41219 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPHP41219 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPHP41219 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPHP41219 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPHP41219 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPHP41219 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPHP41219 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPHP41219 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPHP41219 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPHP41219 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPHP41219 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPHP41219 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPHP41219 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPHP41219 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPHP41219 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPHP41219 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPHP41219 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPHP41219 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPHP41219 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms