Protein–RNA interactions for Protein: P40225

THPO, Thrombopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THPOP40225 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
THPOP40225 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
THPOP40225 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
THPOP40225 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
THPOP40225 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
THPOP40225 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
THPOP40225 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
THPOP40225 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
THPOP40225 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
THPOP40225 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
THPOP40225 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
THPOP40225 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
THPOP40225 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
THPOP40225 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
THPOP40225 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
THPOP40225 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THPOP40225 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THPOP40225 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THPOP40225 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
THPOP40225 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
THPOP40225 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THPOP40225 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
THPOP40225 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
THPOP40225 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THPOP40225 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
THPOP40225 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
THPOP40225 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
THPOP40225 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THPOP40225 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THPOP40225 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THPOP40225 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
THPOP40225 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THPOP40225 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
THPOP40225 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THPOP40225 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
THPOP40225 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THPOP40225 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
THPOP40225 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
THPOP40225 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
THPOP40225 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
THPOP40225 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
THPOP40225 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
THPOP40225 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
THPOP40225 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
THPOP40225 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
THPOP40225 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
THPOP40225 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
THPOP40225 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
THPOP40225 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
THPOP40225 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
THPOP40225 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
THPOP40225 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
THPOP40225 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
THPOP40225 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
THPOP40225 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
THPOP40225 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
THPOP40225 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
THPOP40225 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
THPOP40225 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
THPOP40225 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
THPOP40225 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
THPOP40225 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
THPOP40225 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
THPOP40225 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
THPOP40225 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
THPOP40225 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
THPOP40225 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
THPOP40225 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
THPOP40225 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
THPOP40225 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
THPOP40225 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
THPOP40225 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
THPOP40225 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
THPOP40225 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
THPOP40225 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
THPOP40225 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
THPOP40225 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
THPOP40225 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
THPOP40225 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
THPOP40225 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
THPOP40225 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
THPOP40225 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
THPOP40225 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
THPOP40225 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
THPOP40225 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
THPOP40225 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
THPOP40225 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
THPOP40225 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
THPOP40225 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
THPOP40225 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
THPOP40225 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
THPOP40225 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
THPOP40225 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
THPOP40225 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
THPOP40225 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
THPOP40225 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
THPOP40225 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
THPOP40225 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
THPOP40225 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
THPOP40225 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms