Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FDFT1P37268 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FDFT1P37268 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms