Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL4P36578 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL4P36578 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL4P36578 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL4P36578 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL4P36578 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL4P36578 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL4P36578 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL4P36578 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL4P36578 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL4P36578 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL4P36578 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL4P36578 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL4P36578 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL4P36578 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL4P36578 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL4P36578 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL4P36578 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL4P36578 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL4P36578 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL4P36578 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL4P36578 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL4P36578 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL4P36578 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL4P36578 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL4P36578 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL4P36578 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL4P36578 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL4P36578 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL4P36578 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL4P36578 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL4P36578 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL4P36578 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL4P36578 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL4P36578 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RPL4P36578 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RPL4P36578 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL4P36578 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL4P36578 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL4P36578 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL4P36578 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL4P36578 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL4P36578 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL4P36578 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL4P36578 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL4P36578 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL4P36578 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL4P36578 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL4P36578 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL4P36578 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL4P36578 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL4P36578 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL4P36578 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL4P36578 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL4P36578 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL4P36578 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL4P36578 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL4P36578 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL4P36578 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL4P36578 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL4P36578 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL4P36578 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL4P36578 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL4P36578 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL4P36578 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL4P36578 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL4P36578 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL4P36578 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL4P36578 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL4P36578 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL4P36578 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL4P36578 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL4P36578 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL4P36578 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL4P36578 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL4P36578 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL4P36578 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL4P36578 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL4P36578 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL4P36578 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL4P36578 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL4P36578 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL4P36578 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL4P36578 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL4P36578 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL4P36578 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL4P36578 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL4P36578 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL4P36578 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL4P36578 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL4P36578 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL4P36578 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL4P36578 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL4P36578 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL4P36578 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL4P36578 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL4P36578 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL4P36578 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL4P36578 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL4P36578 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms