Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP5C1P36542 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms