Protein–RNA interactions for Protein: P34932

HSPA4, Heat shock 70 kDa protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA4P34932 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HSPA4P34932 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HSPA4P34932 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HSPA4P34932 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HSPA4P34932 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HSPA4P34932 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
HSPA4P34932 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HSPA4P34932 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HSPA4P34932 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HSPA4P34932 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HSPA4P34932 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HSPA4P34932 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HSPA4P34932 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HSPA4P34932 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HSPA4P34932 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HSPA4P34932 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HSPA4P34932 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HSPA4P34932 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HSPA4P34932 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HSPA4P34932 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
HSPA4P34932 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
HSPA4P34932 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HSPA4P34932 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HSPA4P34932 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HSPA4P34932 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HSPA4P34932 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HSPA4P34932 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HSPA4P34932 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HSPA4P34932 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HSPA4P34932 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HSPA4P34932 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HSPA4P34932 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HSPA4P34932 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HSPA4P34932 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HSPA4P34932 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HSPA4P34932 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HSPA4P34932 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HSPA4P34932 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HSPA4P34932 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms