Protein–RNA interactions for Protein: P32314

FOXN2, Forkhead box protein N2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN2P32314 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN2P32314 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN2P32314 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN2P32314 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN2P32314 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN2P32314 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN2P32314 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN2P32314 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN2P32314 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN2P32314 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN2P32314 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN2P32314 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN2P32314 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN2P32314 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN2P32314 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN2P32314 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN2P32314 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN2P32314 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN2P32314 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FOXN2P32314 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXN2P32314 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXN2P32314 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXN2P32314 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms