Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXA11P31270 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA11P31270 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms