Protein–RNA interactions for Protein: P30279

CCND2, G1/S-specific cyclin-D2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND2P30279 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCND2P30279 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCND2P30279 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCND2P30279 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCND2P30279 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCND2P30279 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCND2P30279 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCND2P30279 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCND2P30279 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCND2P30279 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCND2P30279 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCND2P30279 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCND2P30279 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCND2P30279 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCND2P30279 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCND2P30279 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCND2P30279 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCND2P30279 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCND2P30279 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCND2P30279 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCND2P30279 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCND2P30279 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCND2P30279 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCND2P30279 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCND2P30279 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCND2P30279 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCND2P30279 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCND2P30279 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCND2P30279 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCND2P30279 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCND2P30279 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCND2P30279 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCND2P30279 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCND2P30279 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCND2P30279 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCND2P30279 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCND2P30279 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCND2P30279 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCND2P30279 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCND2P30279 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCND2P30279 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCND2P30279 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCND2P30279 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCND2P30279 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCND2P30279 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCND2P30279 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCND2P30279 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCND2P30279 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCND2P30279 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCND2P30279 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCND2P30279 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCND2P30279 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCND2P30279 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCND2P30279 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCND2P30279 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCND2P30279 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCND2P30279 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCND2P30279 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCND2P30279 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCND2P30279 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCND2P30279 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCND2P30279 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCND2P30279 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCND2P30279 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCND2P30279 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCND2P30279 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCND2P30279 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCND2P30279 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCND2P30279 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCND2P30279 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCND2P30279 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCND2P30279 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCND2P30279 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCND2P30279 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCND2P30279 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCND2P30279 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCND2P30279 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCND2P30279 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCND2P30279 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCND2P30279 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCND2P30279 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCND2P30279 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCND2P30279 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCND2P30279 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCND2P30279 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCND2P30279 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCND2P30279 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCND2P30279 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCND2P30279 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCND2P30279 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCND2P30279 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCND2P30279 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCND2P30279 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCND2P30279 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCND2P30279 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCND2P30279 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCND2P30279 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCND2P30279 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCND2P30279 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCND2P30279 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms