Protein–RNA interactions for Protein: P28069

POU1F1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU1F1P28069 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
POU1F1P28069 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POU1F1P28069 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POU1F1P28069 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POU1F1P28069 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POU1F1P28069 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
POU1F1P28069 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POU1F1P28069 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POU1F1P28069 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POU1F1P28069 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POU1F1P28069 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POU1F1P28069 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POU1F1P28069 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POU1F1P28069 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POU1F1P28069 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POU1F1P28069 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POU1F1P28069 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POU1F1P28069 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POU1F1P28069 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POU1F1P28069 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POU1F1P28069 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POU1F1P28069 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms