Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms