Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMA4P25789 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PSMA4P25789 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PSMA4P25789 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PSMA4P25789 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
PSMA4P25789 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMA4P25789 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMA4P25789 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMA4P25789 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMA4P25789 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMA4P25789 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PSMA4P25789 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMA4P25789 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMA4P25789 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMA4P25789 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMA4P25789 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms