Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCSHP23434 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCSHP23434 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCSHP23434 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCSHP23434 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCSHP23434 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCSHP23434 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCSHP23434 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCSHP23434 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCSHP23434 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSHP23434 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSHP23434 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSHP23434 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSHP23434 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSHP23434 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSHP23434 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSHP23434 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSHP23434 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSHP23434 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSHP23434 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSHP23434 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSHP23434 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSHP23434 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSHP23434 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSHP23434 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSHP23434 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSHP23434 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSHP23434 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSHP23434 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSHP23434 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCSHP23434 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCSHP23434 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCSHP23434 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCSHP23434 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCSHP23434 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCSHP23434 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCSHP23434 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCSHP23434 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCSHP23434 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCSHP23434 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCSHP23434 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCSHP23434 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GCSHP23434 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCSHP23434 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCSHP23434 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCSHP23434 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCSHP23434 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCSHP23434 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCSHP23434 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCSHP23434 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCSHP23434 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCSHP23434 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCSHP23434 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCSHP23434 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCSHP23434 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCSHP23434 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCSHP23434 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCSHP23434 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCSHP23434 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCSHP23434 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCSHP23434 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GCSHP23434 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCSHP23434 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCSHP23434 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCSHP23434 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCSHP23434 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCSHP23434 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCSHP23434 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCSHP23434 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCSHP23434 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCSHP23434 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCSHP23434 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GCSHP23434 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCSHP23434 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCSHP23434 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCSHP23434 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCSHP23434 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCSHP23434 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCSHP23434 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCSHP23434 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCSHP23434 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCSHP23434 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCSHP23434 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GCSHP23434 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCSHP23434 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCSHP23434 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCSHP23434 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCSHP23434 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCSHP23434 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCSHP23434 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCSHP23434 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCSHP23434 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCSHP23434 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCSHP23434 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCSHP23434 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCSHP23434 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCSHP23434 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCSHP23434 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCSHP23434 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCSHP23434 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms