Protein–RNA interactions for Protein: P23258

TUBG1, Tubulin gamma-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBG1P23258 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TUBG1P23258 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms