Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XPAP23025 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XPAP23025 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XPAP23025 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XPAP23025 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
XPAP23025 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XPAP23025 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
XPAP23025 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XPAP23025 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XPAP23025 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XPAP23025 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XPAP23025 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XPAP23025 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XPAP23025 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XPAP23025 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XPAP23025 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XPAP23025 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XPAP23025 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
XPAP23025 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XPAP23025 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XPAP23025 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XPAP23025 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
XPAP23025 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XPAP23025 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XPAP23025 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XPAP23025 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XPAP23025 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XPAP23025 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XPAP23025 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
XPAP23025 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XPAP23025 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XPAP23025 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XPAP23025 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XPAP23025 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XPAP23025 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XPAP23025 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XPAP23025 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XPAP23025 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XPAP23025 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XPAP23025 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XPAP23025 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XPAP23025 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XPAP23025 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
XPAP23025 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XPAP23025 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XPAP23025 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XPAP23025 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XPAP23025 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XPAP23025 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XPAP23025 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XPAP23025 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
XPAP23025 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XPAP23025 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XPAP23025 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XPAP23025 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XPAP23025 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XPAP23025 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XPAP23025 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XPAP23025 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XPAP23025 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
XPAP23025 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
XPAP23025 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
XPAP23025 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
XPAP23025 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
XPAP23025 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XPAP23025 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XPAP23025 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XPAP23025 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XPAP23025 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XPAP23025 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
XPAP23025 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XPAP23025 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XPAP23025 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
XPAP23025 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XPAP23025 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
XPAP23025 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XPAP23025 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XPAP23025 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XPAP23025 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XPAP23025 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XPAP23025 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
XPAP23025 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XPAP23025 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPAP23025 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPAP23025 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPAP23025 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPAP23025 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPAP23025 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPAP23025 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPAP23025 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPAP23025 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPAP23025 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
XPAP23025 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPAP23025 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XPAP23025 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XPAP23025 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XPAP23025 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XPAP23025 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XPAP23025 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XPAP23025 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms