Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NR4A1P22736 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NR4A1P22736 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NR4A1P22736 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NR4A1P22736 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NR4A1P22736 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NR4A1P22736 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NR4A1P22736 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NR4A1P22736 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NR4A1P22736 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NR4A1P22736 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NR4A1P22736 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NR4A1P22736 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms