Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTF3P20783 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTF3P20783 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTF3P20783 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTF3P20783 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTF3P20783 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTF3P20783 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTF3P20783 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTF3P20783 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTF3P20783 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTF3P20783 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTF3P20783 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTF3P20783 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTF3P20783 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTF3P20783 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTF3P20783 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTF3P20783 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTF3P20783 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NTF3P20783 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTF3P20783 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTF3P20783 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTF3P20783 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTF3P20783 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTF3P20783 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTF3P20783 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTF3P20783 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTF3P20783 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTF3P20783 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTF3P20783 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTF3P20783 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTF3P20783 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTF3P20783 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTF3P20783 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTF3P20783 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTF3P20783 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTF3P20783 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTF3P20783 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTF3P20783 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTF3P20783 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTF3P20783 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTF3P20783 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTF3P20783 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTF3P20783 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTF3P20783 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTF3P20783 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTF3P20783 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTF3P20783 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTF3P20783 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTF3P20783 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTF3P20783 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTF3P20783 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NTF3P20783 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTF3P20783 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTF3P20783 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTF3P20783 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTF3P20783 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTF3P20783 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTF3P20783 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTF3P20783 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTF3P20783 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTF3P20783 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTF3P20783 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTF3P20783 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTF3P20783 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NTF3P20783 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTF3P20783 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTF3P20783 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTF3P20783 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTF3P20783 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTF3P20783 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTF3P20783 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NTF3P20783 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NTF3P20783 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTF3P20783 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTF3P20783 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTF3P20783 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTF3P20783 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTF3P20783 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTF3P20783 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTF3P20783 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTF3P20783 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTF3P20783 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTF3P20783 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTF3P20783 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTF3P20783 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NTF3P20783 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTF3P20783 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTF3P20783 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTF3P20783 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTF3P20783 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTF3P20783 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTF3P20783 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTF3P20783 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTF3P20783 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTF3P20783 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTF3P20783 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTF3P20783 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTF3P20783 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTF3P20783 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTF3P20783 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms